Le virus Shamonda-Europe a progressé sur une grande partie du territoire français durant l'été 2026, sans doute sous l'effet de mouvements d'animaux et de déplacements des culicoïdes. D'abord identifiée dans les élevages bovins, sa présence a également été détectée depuis chez des chevaux, des ovins, des caprins et des alpagas.
Une méthode de détection de ce nouveau virus SHAV-Europepar RT-PCR a été développée en urgence. Le virus a déjà été identifié par RT-PCR dans 47 départements français : Ain, Allier, Alpes-de-Haute-Provence, Hautes-Alpes, Ardèche, Ardennes, Aveyron, Calvados, Cantal, Corrèze, Corse du Sud, Côte d’Or, Côtes-d'Armor, Creuse, Doubs, Drôme, Finistère, Gers, Haute-Garonne, Ille et Villaine, Isère, Jura, Loire, Haute-Loire, Loire-Atlantique, Lot, Lozère, Manche, Marne, Mayenne, Meurthe-et-Moselle, Meuse, Morbihan, Moselle, Nièvre, Oise, Puy-de-Dôme, Bas-Rhin, Haut-Rhin, Rhône, Sarthe, Saône-et-Loire, Haute-Saône, Savoie, Haute-Savoie, Tarn, Tarn-et-Garonne, Vosges. Les départements en gras ont reçu la confirmation la semaine dernière.
Ces résultats indiquent que le virus aurait pu circuler pendant plusieurs mois sur le territoire de France métropolitaine avant son identification.
Au 23 septembre 2026, des foyers ont également été détectés en Autriche, en Allemagne, en Belgique, en Suisse, au Luxembourg, au Liechtenstein, aux Pays-Bas, dans le Nord de l'Italie (provinces de Trente et de Bolzano) et en Espagne.
Depuis début juillet, les éleveurs et vétérinaires observent une augmentation du nombre de bovins adultes présentant les symptômes suivants :
- Diarrhée soudaine et passagère
- Fièvre durant 2 à 3 jours
- Chute parfois marquée de la production laitière
- Avortements, retours en chaleurs, parfois quelques semaines après la première vague de symptômes
💡Chez les bovins et les ovins, un avortement, c'est l'expulsion du foetus (du 45ème jour de gestation au terme) ou du veau/agneau, soit né mort, soit succombant dans les quarante-huit heures après la naissance.
Dans les cheptels ovins, la proximité génétique de ce virus avec celui de Schmallenberg laisse penser que les agnelages en cours ou à venir pourraient être impactés : agnelages précoces, mortalité, avortements, agneaux petits et faibles ne survivant que quelques heures, pattes arquées.
Les premières enquêtes de terrain :
🐄Une première étude d'impact en France (Kelleci et al, 2026) rapporte une chute de 15 à 75% de production laitière associée à des symptômes d'abattement, anorexie, diarrhée durant de 1 à 6 jours et dans une moindre mesure hyperthermie. Selon cette enquête, 8 à 100 % des animaux de l'élevage peuvent être touchés.
⌛Les cas cliniques étudiés en Suisse (source : IVI au 03/08/2026) font état d'une période symptomatique de 14 à 21 jours.
🦟Ce virus est transmis par des piqures de culicoïdes. Ce sont des moucherons piqueurs de très petite taille (1 à 3 mm).
Des investigations en cours avec les enseignants chercheurs de l'École Vétérinaire Nationale de Toulouse ont démontré la présence du virus au niveau d'encéphales d'avortons. Il est donc plausible que ce virus soit responsable d'avortements, potentiellement à tout stade de gestation.
🐑 La présence du virus Shamonda-Europe a récemment été confirmée chez des ovins en bonne santé, sans aucun signe clinique, en Wallonie (Belgique).
🐎 Il vient d'être démontré que les chevaux peuvent être atteints par Shamonda-Europe. Ce virus a en effet été détecté au niveau de l'encéphale de 2 chevaux décédés présentant des troubles neurologiques inexpliqués, dans les région de Zurich et de Berne, en Suisse. Attention, l'imputabilité de ce virus dans l'apparition des signes cliniques observés reste à confirmer par des investigations complémentaires. Pour plus d'informations pour protéger vos chevaux, une fiche explicative est disponible en bas de cette page.
Cet article sera mis à jour à la lumière des résultats d'analyses à venir.
Les bons réflexes :
📞En cas de signes similaires, contactez votre vétérinaire. Le traitement est uniquement symptomatique : le recours à des anti-inflammatoires est essentiel pour limiter les répercussions sur la santé de l'animal et faciliter la reprise de production laitière.
🐮En cas d'avortement (précoce ou tardif), de veau mort-né, de malformation à la naissance ou de vagues de retours en chaleurs, échangez également avec votre vétérinaire.
🛡En termes de prévention, il est important d'éloigner au maximum les moucherons des animaux d'élevage en mettant en place les actions suivantes :
- nettoyer, désinfecter et désinsectiser les bétaillères et les camions après chaque utilisation
- rentrer les animaux en bâtiment si possible (notamment lors des pics d'activité des culicoïdes, c'est-à-dire à l'aube et au crépuscule)
- créer des courants d'air en ouvrant portes et fenêtres ou à l'aide de ventilateurs
- augmenter la fréquence d'entretien des litières et des sols
- écarter régulièrement les lisiers et fumiers et ne pas les stocker à proximité de vos animaux d'élevage
- ne pas laisser la ration alimentaire toute la journée et éliminer rapidement les refus
- retirer les pneus présents à proximité des zones d'élevage et retourner les seaux à l'envers, pour éviter les zones d'eau stagnante favorable à la ponte des moucherons
- au quotidien, nettoyer le petit matériel dès la fin de son utilisation
- dans le cas de la découverte d'un cadavre, placer le immédiatement dans une zone dédiée, éloignée de vos animaux d'élevage, et utilisez des bacs d'équarrissage dédiés et fermés lorsque la taille le permet (& informer votre vétérinaire lors de mortalité pour éviter de nouveaux décès)
- désinsectiser de manière raisonnée les animaux présentant ces symptômes et les animaux sujets à mouvements (rassemblements, vente, etc.) en veillant à respecter les délais d'attente des médicaments
Les outils diagnostiques :
🧪Le laboratoire Metapath (ENVT) propose une méthode de détection sur avorton (sous couvert de froid positif) et sur prélèvement de sang chez les bovins malades (tube EDTA de préférence)..
Le bovin doit impérativement présenter de la fièvre lors du prélèvement.
Il est conseillé de faire réaliser ces prélèvements sur 3 à 5 bovins différents de l'élevage pour analyse de mélange.
Le coût de l'analyse au laboratoire Metapath s'élève à 40 € HT par mélange auquel s'ajoutent les frais de colissimo.
💉Terana propose désormais une méthode de détection sur avorton (sous couvert de froid positif) et sur prélèvement de sang chez les bovins malades (tube EDTA de préférence).
Le bovin doit impérativement présenter de la fièvre lors du prélèvement.
Les analyses sont uniquement réalisées de manière individuelle.
Le coût de l'analyse s'élève à 38 € HT par bovin.
Le saviez-vous ?
Le virus Shamonda-Europe appartient au genre Orthobunyavirus,groupe Simbu comme le virus Schmallenberg. Deux génotypes différents ont été identifiés sans variations cliniques observées à ce stade :
1️⃣Shamonda Europe 1 (SHAV-EU1) : dans l’Est de la France, en Suisse, au Sud de l’Allemagne et en Espagne
2️⃣Shamonda Europe 2 (SHAV-EU2) : dans l’Ouest de la France, aux Pays-Bas et au Nord de l’Allemagne
Pour plus d'informations sur cet épisode récent touchant à présent l'ensemble de la France, une fiche explicative est disponible en cliquant sur le bouton ci-dessous.